{"id":38929,"date":"2026-07-03T16:22:27","date_gmt":"2026-07-03T14:22:27","guid":{"rendered":"https:\/\/comet.technology\/?p=38929"},"modified":"2026-07-03T16:25:38","modified_gmt":"2026-07-03T14:25:38","slug":"exploracio-de-scenarios-in-silico-en-models-a-la-plataforma-jaqpot","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/comet.technology\/ca\/2026\/07\/03\/exploracio-de-scenarios-in-silico-en-models-a-la-plataforma-jaqpot\/","title":{"rendered":"Exploraci\u00f3 de SCENARIOS in silico en models a la plataforma Jaqpot"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Com a part del projecte SCENARIOS, s&#8217;ha desenvolupat una s\u00e8rie de models in silico que s&#8217;han posat a disposici\u00f3 com a serveis web llestos per utilitzar a trav\u00e9s de la plataforma Jaqpot. S&#8217;ha prestat especial atenci\u00f3 a la reproducci\u00f3 de models cin\u00e8tics basats en la fisiologia basats en la literatura. El codi per replicar els models literaris seleccionats es pot trobar al seg\u00fcent repositori de GitHub: <a href=\"https:\/\/github.com\/ntua-unit-of-control-and-informatics\/PFAS_PBK_models\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/github.com\/ntua-unit-of-control-and-informatics\/PFAS_PBK_models<\/a>. Aquest repositori cont\u00e9 codi R per reproduir el model PBK literari que descriu la biodistribuci\u00f3 de PFAS en m\u00faltiples esp\u00e8cies. La llista de models PBK disponibles, que s&#8217;actualitzar\u00e0 al llarg de la vida del projecte, inclou actualment els models seg\u00fcents:     <\/p>\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Humans:<ul><li>PFOS\/PFOA (Loccisano et al., 2011)<\/li><\/ul><ul><li>PFAAs (Fabrega et al., 2015)<\/li><\/ul>\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>PFOS\/PFOA (Fabrega et al., 2016)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n\n\n\n<li>Rates:<ul><li> PFOA [mascle, femella] (Loccisano et al., 2012, Worley i Fisher, 2015)<\/li><\/ul><ul><li> PFOS [mascle, femella] (Loccisano et al., 2012)<\/li><\/ul><ul><li> PFHxS [mascle, femella] (Kim et al., 2018)<\/li><\/ul><ul><li> PFNA [mascle, femella] (Kim et al., 2019)<\/li><\/ul>\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li> PFDA [mascle, femella] (Kim et al., 2019)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n\n\n\n<li>Peix:<ul><li> PFOS Truita arc de Sant Mart\u00ed PBPK (Vidal et al., 2020)<\/li><\/ul>\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li> PFAAs que s&#8217;uneixen a prote\u00efnes PBK de peix (Ng i Konrad Hungerb\u00fchler, 2013)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Aquests models s&#8217;han desplegat com a aplicacions web llestes per utilitzar a la plataforma Jaqpot (<a href=\"https:\/\/app.jaqpot.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/app.jaqpot.org<\/a>). Per utilitzar aquestes aplicacions web, cal accedir a l&#8217;organitzaci\u00f3 SCENARIOS. Per obtenir-ne acc\u00e9s, els usuaris finals han d&#8217;enviar un correu electr\u00f2nic a hsarimv@central.ntua.gr sol\u00b7licitant perm\u00eds per unir-se a l&#8217;organitzaci\u00f3. Tingueu en compte que per veure l&#8217;organitzaci\u00f3 SCENARIOS a Jaqpot, primer heu de rebre una invitaci\u00f3.   <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Jaqpot \u00e9s una plataforma computacional desenvolupada per NTUA que facilita la modelitzaci\u00f3 in silico, permetent la producci\u00f3, recopilaci\u00f3, organitzaci\u00f3, validaci\u00f3, emmagatzematge i compartici\u00f3 sistem\u00e0tica de models predictius, amb \u00e8mfasi en la toxicologia predictiva. La interf\u00edcie gr\u00e0fica d&#8217;usuari (GUI) de Jaqpot indica als desenvolupadors de models que documentin encara m\u00e9s els seus models d&#8217;una manera que pugui ser f\u00e0cilment entesa i utilitzada per usuaris finals amb poca o cap experi\u00e8ncia en aprenentatge autom\u00e0tic i an\u00e0lisi estad\u00edstica. La GUI tamb\u00e9 permet als usuaris finals aplicar els models a les seves pr\u00f2pies dades amb finalitats de validaci\u00f3 i\/o predicci\u00f3, i els resultats es recopilen i visualitzen en taules, gr\u00e0fics i informes generats autom\u00e0ticament. Jaqpot admet tots els principals algoritmes d&#8217;aprenentatge autom\u00e0tic i basats en dades estad\u00edstiques, integrant biblioteques populars com ara Python Scikit-learn i R Caret. Jaqpot ha estat dissenyat com una plataforma web gen\u00e8rica de modelitzaci\u00f3 i aprenentatge autom\u00e0tic, per\u00f2 es posa especial \u00e8mfasi en satisfer les necessitats de les comunitats quimio\/bio\/nano\/farmac\u00e8utica integrant models QSAR, biocin\u00e8tica, dosi-resposta i extrapolaci\u00f3. Jaqpot ha estat desenvolupat per la Unitat de Control de Processos i Inform\u00e0tica de l&#8217;Escola d&#8217;Enginyeria Qu\u00edmica de la Universitat T\u00e8cnica Nacional d&#8217;Atenes.     <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">A la Figura 1 es presenta una visi\u00f3 general dels models que s&#8217;han carregat a la inst\u00e0ncia SCENARIOS de Jaqpot.<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-1024x495.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28583\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 1: Models de SCENARIOS a Jaqpot<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Breument, la interf\u00edcie gr\u00e0fica d&#8217;usuari del model Jaqpot consta de 4 pestanyes diferents: \u00abVisi\u00f3 general\u00bb, \u00abCaracter\u00edstiques\u00bb, \u00abPredicci\u00f3\/Validaci\u00f3\u00bb i \u00abDiscussi\u00f3\u00bb. Podeu trobar una descripci\u00f3 del model a la pestanya \u00abVisi\u00f3 general\u00bb (Figura 2). Els usuaris finals poden veure m\u00e9s detalls sobre les caracter\u00edstiques dependents i independents del model a la pestanya \u00abCaracter\u00edstiques\u00bb (Figura 3). <\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-1-1024x495.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28584\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 2: Pestanya \u00abVisi\u00f3 general\u00bb.<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-2-1024x497.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28585\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 3: Pestanya \u00abCaracter\u00edstiques\u00bb.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">A la pestanya \u00abPredir\/Validar\u00bb, els usuaris finals poden proporcionar una inst\u00e0ncia del model (Figura 4) i adquirir prediccions del model, que en el cas dels models biocin\u00e8tics\/PBK es poden representar gr\u00e0ficament mitjan\u00e7ant el m\u00f2dul de gr\u00e0fics de Jaqpot (Figura 5).<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-3-1024x494.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28586\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 4: Pestanya \u00abPredicci\u00f3\u00bb.<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-4-1024x491.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28587\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 5: Perfil de concentraci\u00f3-temps d&#8217;un model PBK.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Podeu trobar m\u00e9s informaci\u00f3 sobre com utilitzar Jaqpot a <a href=\"https:\/\/zenodo.org\/communities\/nanocommons?q=&amp;f=subject%3ABiokinetics&amp;l=list&amp;p=1&amp;s=10&amp;sort=newest\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/zenodo.org\/communities\/nanocommons?q=&amp;f=subject%3ABiokinetics&amp;l=list&amp;p=1&amp;s=10&amp;sort=newest<\/a><strong><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Com a part del projecte SCENARIOS, s&#8217;ha desenvolupat una s\u00e8rie de models in silico que s&#8217;han posat a disposici\u00f3 com a serveis web llestos per utilitzar a trav\u00e9s de la plataforma Jaqpot. S&#8217;ha prestat especial atenci\u00f3 a la reproducci\u00f3 de models cin\u00e8tics basats en la fisiologia basats en la literatura. El codi per replicar els [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":38936,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[714],"tags":[],"class_list":["post-38929","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-scenarios-ca"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/38929","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=38929"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/38929\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":38934,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/38929\/revisions\/38934"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media\/38936"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=38929"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=38929"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/comet.technology\/ca\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=38929"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}