{"id":38931,"date":"2026-07-03T16:22:27","date_gmt":"2026-07-03T14:22:27","guid":{"rendered":"https:\/\/comet.technology\/?p=38931"},"modified":"2026-07-03T16:27:27","modified_gmt":"2026-07-03T14:27:27","slug":"explorando-scenarios-en-modelos-in-silico-en-la-plataforma-jaqpot","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/comet.technology\/es\/2026\/07\/03\/explorando-scenarios-en-modelos-in-silico-en-la-plataforma-jaqpot\/","title":{"rendered":"Explorando SCENARIOS en modelos in silico en la plataforma Jaqpot"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Como parte del proyecto SCENARIOS, se ha desarrollado una serie de modelos in silico que se han puesto a disposici\u00f3n como servicios web listos para usar a trav\u00e9s de la plataforma Jaqpot. Se ha prestado especial atenci\u00f3n a la reproducci\u00f3n de modelos cin\u00e9ticos basados \u200b\u200ben la fisiolog\u00eda (PBK) de la literatura cient\u00edfica. El c\u00f3digo para replicar los modelos seleccionados se encuentra en el siguiente repositorio de GitHub: <a href=\"https:\/\/github.com\/ntua-unit-of-control-and-informatics\/PFAS_PBK_models\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/github.com\/ntua-unit-of-control-and-informatics\/PFAS_PBK_models<\/a>. Este repositorio contiene c\u00f3digo R para reproducir modelos PBK de la literatura que describen la biodistribuci\u00f3n de PFAS en m\u00faltiples especies. La lista de modelos PBK disponibles, que se actualizar\u00e1 a lo largo del proyecto, incluye actualmente los siguientes modelos:     <\/p>\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Humanos:<ul><li>PFOS\/PFOA (Loccisano et al., 2011)<\/li><\/ul><ul><li>PFAAs (Fabrega et al., 2015)<\/li><\/ul>\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>PFOS\/PFOA (Fabrega et al., 2016)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n\n\n\n<li>Ratas:<ul><li> PFOA [macho, hembra] (Loccisano et al., 2012, Worley and Fisher, 2015)<\/li><\/ul><ul><li> PFOS [macho, hembra] (Loccisano et al., 2012)<\/li><\/ul><ul><li> PFHxS [macho, hembra] (Kim et al., 2018)<\/li><\/ul><ul><li> PFNA [macho, hembra] (Kim et al., 2019)<\/li><\/ul>\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li> PFDA [macho, hembra] (Kim et al., 2019)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n\n\n\n<li>Peces:<ul><li> PFOS Trucha arco\u00edris PBPK (Vidal et al., 2020)<\/li><\/ul>\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li> PFAAs que se unen a prote\u00ednas PBK en peces (Ng y Konrad Hungerb\u00fchler, 2013)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Estos modelos se han implementado como aplicaciones web listas para usar en la plataforma Jaqpot (<a href=\"https:\/\/app.jaqpot.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/app.jaqpot.org<\/a>). Para utilizar estas aplicaciones web, se requiere acceso a la organizaci\u00f3n SCENARIOS. Para obtener acceso, los usuarios finales deben enviar un correo electr\u00f3nico a hsarimv@central.ntua.gr solicitando permiso para unirse a la organizaci\u00f3n. Tenga en cuenta que para ver la organizaci\u00f3n SCENARIOS en Jaqpot, primero debe haber recibido una invitaci\u00f3n.   <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Jaqpot es una plataforma computacional desarrollada por NTUA que facilita el modelado in silico, permitiendo la producci\u00f3n, recopilaci\u00f3n, organizaci\u00f3n, validaci\u00f3n, almacenamiento y compartici\u00f3n sistem\u00e1ticas de modelos predictivos, con especial \u00e9nfasis en la toxicolog\u00eda predictiva. La interfaz gr\u00e1fica de usuario (GUI) de Jaqpot gu\u00eda a los desarrolladores de modelos para que documenten sus modelos de forma que sean f\u00e1cilmente comprensibles y utilizados por usuarios finales con poca o ninguna experiencia en aprendizaje autom\u00e1tico y an\u00e1lisis estad\u00edstico. La GUI tambi\u00e9n permite a los usuarios finales aplicar los modelos a sus propios datos para fines de validaci\u00f3n y\/o predicci\u00f3n, y los resultados se recopilan y visualizan en tablas, gr\u00e1ficos e informes generados autom\u00e1ticamente. Jaqpot es compatible con los principales algoritmos de aprendizaje autom\u00e1tico y an\u00e1lisis estad\u00edstico, gracias a la integraci\u00f3n de bibliotecas populares como Scikit-learn de Python y Caret de R. Jaqpot se ha dise\u00f1ado como una plataforma web gen\u00e9rica de modelado y aprendizaje autom\u00e1tico, pero se ha puesto especial \u00e9nfasis en satisfacer las necesidades de las comunidades de quimio, bio, nano y farmac\u00e9utica mediante la integraci\u00f3n de modelos QSAR, biocin\u00e9ticos, de dosis-respuesta y de extrapolaci\u00f3n. Jaqpot ha sido desarrollado por la Unidad de Control de Procesos e Inform\u00e1tica de la Facultad de Ingenier\u00eda Qu\u00edmica de la Universidad T\u00e9cnica Nacional de Atenas.     <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">En la Figura 1 se presenta una descripci\u00f3n general de los modelos que se han cargado en la instancia SCENARIOS de Jaqpot.<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-1024x495.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28583\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 1: Modelos de SCENARIOS en Jaqpot<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">En resumen, la interfaz gr\u00e1fica de usuario (GUI) del modelo Jaqpot consta de cuatro pesta\u00f1as distintas: \u00abDescripci\u00f3n general\u00bb, \u00abCaracter\u00edsticas\u00bb, \u00abPredicci\u00f3n\/Validaci\u00f3n\u00bb y \u00abAn\u00e1lisis\u00bb. En la pesta\u00f1a \u00abDescripci\u00f3n general\u00bb (Figura 2) se encuentra disponible una descripci\u00f3n del modelo. Los usuarios finales pueden consultar m\u00e1s detalles sobre las caracter\u00edsticas dependientes e independientes del modelo en la pesta\u00f1a \u00abCaracter\u00edsticas\u00bb (Figura 3). <\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-1-1024x495.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28584\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 2: Pesta\u00f1a \u2018Descripci\u00f3n general\u2019.<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-2-1024x497.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28585\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 3: Pesta\u00f1a \u2018Caracter\u00edsticas\u2019.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">En la pesta\u00f1a \u00abPredecir\/Validar\u00bb, los usuarios finales pueden proporcionar una instancia del modelo (Figura 4) y obtener predicciones del modelo, que en el caso de los modelos biocin\u00e9ticos\/PBK se pueden representar gr\u00e1ficamente utilizando el m\u00f3dulo de gr\u00e1ficos de Jaqpot (Figura 5)..<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-3-1024x494.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28586\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 4: Pesta\u00f1a \u2018Predicci\u00f3n\u2019.<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/scenarios-project.eu\/wp-content\/uploads\/sites\/21\/2026\/07\/image-4-1024x491.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-28587\"\/><\/figure>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Figura 5: Perfil de concentraci\u00f3n-tiempo de un modelo PBK.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Puede encontrar m\u00e1s informaci\u00f3n sobre c\u00f3mo usar Jaqpot en<a href=\"https:\/\/zenodo.org\/communities\/nanocommons?q=&amp;f=subject%3ABiokinetics&amp;l=list&amp;p=1&amp;s=10&amp;sort=newest\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> https:\/\/zenodo.org\/communities\/nanocommons?q=&amp;f=subject%3ABiokinetics&amp;l=list&amp;p=1&amp;s=10&amp;sort=newest<\/a><strong><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Como parte del proyecto SCENARIOS, se ha desarrollado una serie de modelos in silico que se han puesto a disposici\u00f3n como servicios web listos para usar a trav\u00e9s de la plataforma Jaqpot. 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